Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FYCO1Q9BQS8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FYCO1Q9BQS8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms