Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms