Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN18Q99952 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN18Q99952 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms