Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms