Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1Q99536 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms