Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms