Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAP1L3Q99457 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms