Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms