Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
OPALINQ96PE5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPALINQ96PE5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms