Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP3Q96P47 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP3Q96P47 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms