Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms