Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms