Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABS1Q96KC9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CABS1Q96KC9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms