Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPTM1LQ96KA5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms