Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms