Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms