Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms