Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCMH1Q96GD3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCMH1Q96GD3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms