Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDC3Q96F86 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EDC3Q96F86 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms