Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms