Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYAP1Q96A49 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms