Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms