Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLP1Q92989 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLP1Q92989 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms