Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN4Q92575 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN4Q92575 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms