Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC1Q92574 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSC1Q92574 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms