Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELQQ8TDG4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms