Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGBL3Q8NEM8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL3Q8NEM8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms