Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms