Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP38Q8NB14 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms