Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME8Q8N427 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME8Q8N427 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms