Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms