Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX18

DHX40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX40Q8IX18 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX40Q8IX18 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX40Q8IX18 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms