Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms