Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMNL3Q8IVF7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms