Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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