Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PBRM1Q86U86 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PBRM1Q86U86 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PBRM1Q86U86 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PBRM1Q86U86 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PBRM1Q86U86 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms