Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms