Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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