Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT25Q7Z3Z0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT25Q7Z3Z0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT25Q7Z3Z0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT25Q7Z3Z0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT25Q7Z3Z0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT25Q7Z3Z0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT25Q7Z3Z0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT25Q7Z3Z0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT25Q7Z3Z0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms