Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms