Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC11Q7Z392 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC11Q7Z392 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms