Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms