Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms