Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRCAPQ6ZRS2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms