Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPOCD1Q6ZMY3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms