Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM72Q6ZMU5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM72Q6ZMU5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms