Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms