Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms