Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms