Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms